主機入侵檢測系統分析對象為主機審計日志，所以需 要在主機上安裝軟件，針對不同的系統、不同的版本需安裝不同的主機引擎，安裝配置較為復雜，同時對系統的運行和不亂性造成影響，目前在海內應用較少。

　1、IDS存在的問題

  入侵檢測系統(Intrusion Detect System)，目前基本上分為以下兩種：主機入侵檢測系統(HIDS);網絡入侵檢測系統(NIDS)。目前最好綜合使用多種檢測技術，而不只是依賴傳統的統計分析和模式匹配技術。
  網絡入侵監測分析對象為網絡數據流，只需安裝在網絡的監聽端口上，對網絡的運行無任何影響，目前海內使用較為廣泛。模式匹配利用對攻擊的特征字符進行匹配完成對攻擊的檢測。而利用協議分析。利用此技術，有效的降低了誤報和漏報。

  2、缺乏正確定位和處理機制
  IDS技術采用了一種預設置式、特征分析式工作原理，所以檢測規則的更新老是落后于攻擊手段的更新。

  3、機能普遍不足
  IDS僅能識別IP地址，無法定位IP地址，不能識別數據來源。好比異常檢測通常采用統計方法來進行檢測，而統計方法中的閾值難以有效確定，太小的值會產生大量的誤報，太大的值又會產生大量的漏報。但目前因為算法處理和規則制定的難度很大，目前還不長短常成熟，但卻是入侵檢測技術發展的趨勢。而這些檢測方式都存在缺陷。假設此特征泛起在Mail里，由于不符合協議，就不會報警。而在協議分析的檢測方式中，一般的IDS只簡樸地處理了常用的如HTTP、FTP、SMTP等，其余大量的協議報文完全可能造成IDS漏報，假如考慮支持盡量多的協議類型分析，網絡的本錢將無法承受。則只在符合的協議(HTTP)檢測到此事件才會報警。
  入侵檢測誤報和漏報的解決終極依賴分析技術的改進。
  統計分析是統計網絡中相關事件發生的次數，達到判別攻擊的目的。
  行為分析技術不僅簡樸分析單次攻擊事件，還根據前后發生的事件確認是否確有攻擊發生，攻擊行為是否生效，是入侵檢測分析技術的最高境界。因而其缺乏更有效的響應處理機制。另外，規則庫是否及時更新也和檢測的正確程度相關。 IDS系統在發現攻擊事件的時候，只能封閉網絡出口和服務器等少數端口，但這樣封閉同時會影響其他正常用戶的使用。
 
  4、入侵檢測技術的發展趨勢
  現在市場上的IDS產品大多采用的是特征檢測技術，這種IDS產品已不能適應交換技術和高帶寬環境的發展，在大流量沖擊、多IP分片情況下都可能造成IDS的癱瘓或丟包，形成DoS攻擊。
  協議分析技術是在對網絡數據流進行重組的基礎上，理解應用協議，再利用模式匹配和統計分析的技術來判明攻擊。數據重組是對網絡連接的數據流進行重組再加以分析，而不僅僅分析單個數據包。
 
  5、沒有主動防備能力
  IDS常用的檢測方法有特征檢測、異常檢測、狀態檢測、協議分析等。例如：某個基于HTTP協議的攻擊含有ABC特征，假如此數據分散在若干個數據包中，如：一個數據包含A，另外一個包含B，另外一個包含C，則單純的模式匹配就無法檢測，只有基于數據流重組才能完整檢測。目前入侵檢測分析方法主要有：統計分析、模式匹配、數據重組、協議分析、行為分析等。